我们的教程主要是以一个具体的例子作为线索,通过对公共数据库数据bulk-RNA-seq的挖掘,利用生物信息学分析来探索目标基因集作为某种疾病数据预后基因的潜能及其潜在分子机制,同时在单细胞水平分析(对scRNA-seq进行挖掘)预后基因的表达,了解细胞之间的通讯网络,以期为该疾病临床治疗提供新的参考,同时我们还可以经过分子对接实现药物靶点的初步筛选。
文章目录
- 一、背景
- 1. 功能富集分析的必要性
- 2. GO与KEGG数据库的区别
- 3. PPI网络分析的补充作用
- 二、功能富集分析实战
- 1.GO/KEGG分析
- 2.PPI分析
一、背景
1. 功能富集分析的必要性
- 差异基因的解读需求:高通量测序(如RNA-seq)通常会产生大量差异表达基因(DEGs),但这些基因